A Karsten capta a água que consome do rio do Testo, em Blumenau, utilizando, tratando e devolvendo-a mais limpa do que na captação. A própria empresa faz o tratamento da água para o consumo humano e para o processo industrial. O tratamento dos 190 m³/h de efluentes é feito pelo sistema biológico, físico-químico, obtendo eficiência próxima de 100% de remoção da carga poluente.
Como prova do pioneirismo na utilização racional da água, a Karsten foi a primeira indústria têxtil catarinense a instalar uma Estação de Tratamento de Efluentes pelo sistema biológico, em 1988, com capacidade
para 210m³/h e que absorveu investimento em torno de 2,5 milhões de dólares. No processo biológico de depuração, os microorganismos são aclimatados para remover a matéria orgânica do efluente.
O tratamento de efluentes está em constante aperfeiçoamento. Como exemplo desta evolução podemos citar o projeto inédito desenvolvido pelos próprios funcionários da Karsten para a secagem do lodo industrial, reduzindo de 270 para 60 toneladas por mês a deposição deste resíduo no aterro industrial.